Trường được khởi công xây dựng từ năm 1966, đến năm 1967 đưa vào hoạt động, trường mang tên là Trường Trung học Công Thanh Biên Hòa.
Ngày1/ 6/ 1975, chính quyền cách mạngtiếp thu và đổi tên Trường là trường cấp II, III Vĩnh Cửu.
Đến năm 1985 đổi tên là trường Phổ thông cấp 2 Thạnh Phú.
Năm 1994 trường đổi tên là Trường THCS Thạnh Phú.